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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

西藏林芝派墨公路雪崩已致8人遇难 应急管理部派工作组赴西藏指导处置******

　　中新社北京1月18日电 (记者 郭超凯 陈溯)记者18日从中国应急管理部获悉，西藏林芝市米林县派镇至墨脱公路多雄拉隧道出口(墨脱方向)17日发生雪崩，致人员和车辆被困。应急管理部派出工作组赶赴西藏指导地方做好灾害应对处置工作。

　　接报后，应急管理部持续调度指导搜救处置工作，部长王祥喜立即作出部署，要求全力以赴开展救援，尽快核准人数和被埋车辆情况，加强监测预警和转移避险措施，严防次生灾害，做好应急处置和防范应对工作。

　　灾害发生后，当地国家综合性消防救援队伍连夜出动131人、28车赶赴现场救援。

　　另据西藏自治区林芝市委消息，1月17日19时50分许，林芝市墨脱县公安局110指挥中心接群众报警称：米林县派镇至墨脱公路多雄拉隧道出口(墨脱方向)发生雪崩，致人员和车辆被困。截至目前，搜救人员已发现遇难者8人，失联人员搜救工作正有序推进。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）